1. Pierwotnie film miał opowiadać o 'zielonych' aktywistach uwalniających zwierzęta z zoo.

2.Inspiracją do stworzenia dżungli Madagaskaru były obrazy francuskiego artysty Henriego Rousseau.

3.Animatorzy filmu nienaturalnie "zgięli" szyję żyrafy Melmana, ponieważ... nie mieściła się w kadrze z głowami innych, znacznie mniejszych od niej zwierząt.

4.Scena, w której po tym jak Melman podpalił Lady Liberty Alex krzyczy "Ty maniaku.....", jest zapożyczeniem z ostatniej sceny filmu "Planeta Małp".

5. W scenie, w której babcia przemawia w dżungli do zagubionych uczestników safari jej cień przypomina Statuę Wolności.

6.Filmowe zoo jest nawiązaniem do prawdziwego nowojorskiego zoo w Central Parku, ale istniejącego w latach 60. XX wieku. Co ciekawe na początku filmu, gdy mały Alex przypływa skrzynką do Nowego Jorku widać wyraźnie bliźniacze wieże WTC w tle. Dzieciństwo głównych bohaterów rozgrywa się w 1972 roku.

7."Moto Moto" w języku Suahili oznacza "Gorący Gorący".

8.Wrodzone znamię rodziny Alexa jest w kształcie kontynentu afrykańskiego, łącznie z wyspą Madagaskar.