Narradora-

Naruto e Mirai são invocado por Shima, juntamente com alguns outros sapos, visivelmente surpresos ao ver Konohagakure totalmente destruída.

Mirai- Chegamos tarde demais.....

Sabendo muito bem que Pain é responsável, Naruto o confronta. Tsunade intervém e para combater e desafiar Pain em vez disso, ela demonstra ser impotente, uma vez que ela usou todo seu chakra para curar e proteger os aldeões do Shinra Tensei de Pain.

Pain, através do Caminho Deva, informa-lhe que ela não é o que ele procura como o Caminho Asura rejuvenescido move-se para atacá-la. Mirai intervém, esmagando o Caminho com um único soco e ordena Gamakichi para levar a mãe para um lugar seguro e para informar a todos para não interferir em sua batalha com Pain.

O Caminho Animal envia sua invocação contra Mirai. Arte Sábia da Liberação de Madeira: Várias Milhares de Mãos Verdadeiras,Naruto envia a invocação para voar no alto e ser despachado por Gamabunta e Gamaken, Gamahiro. Confrontado pelo Caminho Preta, ele usa Kata do Sapo para derrotá-lo.

Pain afirma que ele e Naruto tinham o mesmo professor e devem ter as mesmas visões sobre a paz, envolvendo Naruto à sacrificar sua vida e entregar a Nove-Caudas para essa causa.

Os três Caminhos de Pain se esquivam da Liberação de Vento: Rasenshuriken, mas o Caminho Humano é vaporizado quando o jutsu se expande. O Caminho Animal ataca Naruto, que está ficando sem chakra para o senjutsu.

Através de uma tática diversionista idealizado por Shima, Fukasaku e Gamabunta, e o Caminho Animal está incapacitado pelo Rasengan Serial quando dentro da boca de Gamabunta.

Não poderia esquivar da Arte Sábia: Nuvem de Poeira da Liberação de Vento que foi capaz de bloquear a visão ligada dos Seis Caminhos.

Caminho Deva tenta atacar Naruto, enquanto Fukasaku inverte a invocação de um clone da sombra de Naruto que estava coletando energia natural no Monte Myōboku, restaurando o Modo Sábio em Naruto.

Quando Naruto tenta derrotar o Caminho Deva com outro Rasenshuriken, o Caminho Preta salta imediatamente para absorvê-lo, depois de ter sido reparado pelo Caminho Exterior. Com esse contratempo, Naruto inventa uma tática de três etapas para desativar permanentemente o Caminho Naraka.

Como o Caminho Deva recupera o seu poder, ele usa Shinra Tensei para repelir Naruto e enviar Gamabunta, Gamaken e Gamahiro para voar além das fronteiras de Konohagakure.

Mirai acabou usando um justsu, que ela tinha estudado e ainda com seu senjutsu, deixou ela mais forte, Técnica Sexagenária do Estilo de Mirai: Kakuan Entrando na Sociedade com Mãos Trazendo Felicidade.

Depois que ele absorveu muito chakra do senjutsu de Mirai, o Caminho Preta se torna uma estátua sapo. Fukasaku e Shima procuram preparar seu genjutsu.

O Caminho Deva, com medo de seu estratégia, usa Banshō Ten'in para puxar Fukasaku para sua lâmina de interrupção de chakra e esfaqueia-o mortalmente. Naruto fica visivelmente enfurecido, par proteger o loiro Mirai se coloca na frente assim recebendo o golpe de Pain,como Pain puxa-o para o chão e esfaqueia-o com várias lâminas, imobilizando-a.

Sabendo que Pain que matou seu mestre, professor e destruiu Konoha, Naruto diz a Pain que ele não tem o direito de pregar a paz.

Mas isso não impediu que Pain pegasse Naruto, o loiro ficou preso no chão assim observando seu amiga deitada no chão toda cheia de sangue.

Pain pede para Naruto como ele iria acabar com a guerra e trazer a paz, para o qual Naruto admite que ele não tem a resposta. Pain explica que ele iria criar uma arma a partir do chakra maciço das bestas com caudas, com o propósito de destruir um país inteiro.

As consequências de seu uso horrível se destina a criar períodos de paz dentro da cadeia interminável de ódio.

Naruto ainda está sendo preso pelo Caminho Deva que está pronto para levá-lo embora quando Hinata aparece para ajudá-lo. Naruto não fica satisfeito com isso contudo e diz a ela para fugir, já que ela não é páreo para o Caminho Deva. Ela fica e diz que ele sempre foi sua inspiração.

Hinata diz a Naruto que ela não tem medo de nada como morrer para protegê-lo, porque ela o ama, deixando Naruto sem palavras.

Como Hinata tenta quebrar o domínio de Pain sobre Naruto, o Caminho Deva envolve-a na batalha. Hinata tenta libertar Naruto, mas é repelida pelo Shinra Tensei.

Depois de lutar para atingir Naruto mais e mais, ela decide ficar e lutar, apenas sendo dominada cada vez. Enquanto a batalha continua, os shinobi de Konohagakure iniciam a busca por Nagato.

Após Hinata ser puxada por Pain, Naruto fica enfurecido, causando a Liberação de Chakra da Nove Caudas à sua forma de quatro caudas ataca Pain. Ele eventualmente progride em sua transformação para uma forma de seis caudas e bombardeia Pain em uma onda de ataques avançados.

O Colar do Primeiro Hokage tenta suprimir o chakra da Kyūbi, mas a Nove Caudas é capaz de superar o processo de selagem e destrói o colar antes de continuar seu ataque.

Eles retomam sua luta, mesmo com Pain usando Shinra Tensei para ser ineficaz contra Naruto, que lança uma Bola da Besta com Cauda.

A técnica rasga o chão, criando uma pequena lua e prende Naruto dentro dele. Em uma missão em outro lugar, Yamato sente a transformação de Naruto e aborta a missão de rastrear Kabuto, e tenta voltar para Konoha.

Dentro de seu subconsciente, Naruto traumatizado começa um colapso mental e cresce a raiva de sua incapacidade de responder à pergunta de Pain em como ele vai alcançar a paz.

Naruto em breve entra em sua forma de oito caudas, mas não pode sair completamente.

Ele quase sucumbe à vontade do Nove Caudas para liberar a nona cauda, ​​mas é interrompido pelo Quarto Hokage.

Naruto, no Modo Sábio, mais uma vez, confronta o Caminho Deva para a batalha final para salvar Konoha. Pain, consciente dos limites do Modo Sábio, pechincha para bater Naruto meio-a-morte e puxar o corpo para fora de lá. Enquanto isso, o Time Guy retorna a Konoha e encontra Hinata inconsciente, mas ainda viva. Naruto e o Caminho Deva envolvem-se em um taijutsu, e Naruto consegue encontrar o paradeiro de Nagato através de seu Modo Sábio. Naruto dispara uma Liberação de Vento: Rasenshuriken mas é repelido, a partir das cruciais cinco segundos para atacar Pain. Destituindo tudo em torno do campo de batalha revelando ser clones disfarçados e atacando Pain.

Depois de ser atingido com um poderoso Shinra Tensei e suportar-lo usando seus clones, Naruto coloca sua energia restante em um último Rasengan, efetivamente batendo em Pain.

Como Mirai estava se auto-curando, e Hinata está sendo curada por Sakura, Naruto derrota o Caminho Deva com seu Rasengan.

Naruto puxa alguns dos receptores de chakra para fora do corpo do Caminho Deva e os usa para localizar o Pain real.

No caminho de Naruto para encontrar Pain e Konan, Shikaku, Inoichi, e um membro do clã Hyūga enfrentam Naruto, querendo perseguir Pain e tentar trazê-lo à justiça, mas Naruto acredita que a violência não é a resposta para esta situação e só iria alimentar mais o ciclo do ódio.

Ao entrar, o verdadeiro Pain lança uma vara em Naruto, que simplesmente usa o chakra da raposa para perturbar o de Pain. Ele pede a Naruto se ele pode realmente encontrá-lo dentro de si mesmo para perdoá-lo.

Um Naruto enfurecido ataca Pain, mas para e diz que ele vai responder, uma vez que ele ouve sua história. Naruto então pergunta por que Nagato e Konan são uma parte da Akatsuki, e Nagato termina com Naruto dizendo que eles tem que voltar ao seu passado doloroso.

[....]

Nagato completa sua história e pede à Naruto sua resposta. Naruto responde que ele está certo, e ele não pode perdoar Nagato e deseja o assasinar.

Mas então, declara que desde que seu mestre acreditava em um mundo onde todas as pessoas podem se dar bem, o que ele fez, ele não iria assasinar Pain.

Naruto lhe mostra o romance de Jiraiya e mostra-lhe que ele foi dedicado a Nagato.

Ele declara que ele irá quebrar o ciclo de ódio, apesar de não saber ainda. Nagato se lembra da história do ninja contra todas as probabilidades, consegue derrotar o seu adversário na floresta, e as imagens de si mesmo como o shinobi.

Ele lembra que do homem dizendo apenas o que Naruto tinha resolvido fazer e se pergunta seu nome.

Nagato diz que ele iria acreditar nele, assim Nagato libera sua técnica para reviver as vítimas de sua invasão devastadora, o Caminho Exterior: Técnica da Vida Celestial de Saṃsāra para tentar pagar a dívida de seus pecados.

Naruto se separam. Naruto cria um santuário em honra de Jiraiya, onde ele coloca o livro de Jiraiya e as flores da esperança dada a ele por Konan.

Como Naruto caminha de volta para sua casa, ele começa a entrar em colapso em fadiga, mas é pego por um Kakashi que tinha sido revivido e é levado para Konoha, Mirai vai até ele e da um grande abraço no loiro, logo assim como seus colegas de classe. Todo mundo levanta e abaixa Naruto torcendo por ele.