La Rainbow Rocket, la Team Galaxy, La Team Flare, La team Skull et la Fondation Aether ont unis leur force pour ouvrir des Ultra-Brèches Sigma, des ultra-brèches dans les ultra-brèches dont les pokémons seraient si puissants et redoutables que rien ne pourrait les arrêter... Et c'est effectivement ce qui est arrivé ! Suite à une perte de contrôle, des ultra-chimères dangereuses et mystérieuses envahissent les différentes régions. Face à l'urgence, les maîtres pokémons ont créé une division spéciale chez les pokérangers afin de parer au danger appelé la Brigade de Neutralisation des Ultra chimères ou BNU. Shiraz, une jeune dresseuse est pour le moment indécise quant à l'objectif de son voyage depuis les événements récents  tandis que Deborah, cheffe de la Team Domino, voit cette bêtise comme une entrave à son plan de conquête du monde et donc, va rejoindre les gentils... Temporairement...