Para dar un ejemplo de cómo funciona esto hagamos algo sencillo, analicemos el fenotipo y genotipo de Inojin Yamanaka pero nos centraremos en el cabello y los ojos.

Como podemos observar, Sai tiene ojos oscuros mientras que Ino e Inojin tienen ojos claros.
Los ojos oscuros son un alelo dominante y en este caso lo representarnos como "R".

(los alelos se representan con letras, siendo los dominantes mayúsculas y los recesivos minúsculas pero fuera de eso puede ser cualquier letra)

Y los ojos claros por otra parte, son alelos recesivos por lo que en este caso se representarán como "r".

Aquí la cuestión es que si tienes un alelo recesivo y uno dominante, se manifiesta el dominante.
RR = ojos oscuros
Rr = ojos oscuros
rR = ojos oscuros
rr = ojos claros

Un alelo recesivo se manifiesta únicamente cuando hay otro alelo recesivo, por lo tanto Inojin debería recibir en su genotipo un alelo "r" por parte de Ino, que vemos que si lo tiene, y un alelo "r" por parte de Sai... ¿Qué pasó aquí? ¿A caso a Sai le pusieron los cuernos? Aquí es donde entra el pedigree

En estos diagramas los cuadrados representan a los hombres y los círculos a las mujeres, por lo tanto el cuadrado central es Inojin que como ya vimos tiene alelos recesivos que se expresan como ojos claros.
Ahora, el círculo que conecta directamente con Inojin representa a Ino, quien también tiene ojos claros y por lo tanto alelos rr. Ella a su vez está conectada hacia arriba con otro círculo (su mamá) y un cuadrado (Inocihi)

El padre también tiene ojos claros por lo tanto posee rr.

La madre tiene ojos cafes pero si nos fijamos en la tonalidad, son claros también así que también posee rr.

Hasta aquí todo está en orden, pero ¿qué pasa con Sai? Él tiene ojos oscuros, por lo tanto posee uno o dos alelos dominantes

Y ¿cómo sabemos cuál de los dos es? Si se tiene la certeza de que Inojin es su hijo biológico pues se podría concluir que él posee alelos Rr, pero como en este caso hipotético no tenemos es seguridad, tendríamos que recurrir a los padres (cosa que tampoco tenemos pero vamos a suponer).

En esta suposición se pueden hacer varias combinaciones pero quedémonos con una.
Suponiendo que la madre es de ojos oscuros (Rr) y el padre también (RR) cada uno hereda a su hijo uno sólo, dando como resultado RR, entonces si, Ino le puso los cuernos ya que Sai tendría que haberle heredado a Inojin un alelo r para que pudiera tener ojos claros y no importa que el r esté presente en la abuela paterna ya que si ella no lo hereda al padre, este no puede heredarlo al hijo porque no lo tiene.

Ahora, siguiendo con el ejemplo de que la madre de Sai tiene Rr y su padre RR.
Si la madre le hereda su r y el padre una R, Sai presenta un Rr, por lo tanto si puede heredarle a Inojin un r aún teniendo él ojos oscuros.

Cuando tenemos un caso RR se le llama homocigoto dominante.
A un caso rr se le llama homocigoto recesivo.

Cuando tenemos un caso Rr o rR (que son lo mismo) se le llama heterocigoto.

Por lo tanto se puede decir que todos en la familia de Ino son homocigotos recesivos y que para que Inojin sea hijo legítimo de Sai, este tendría que ser un heterocigoto (ya que su fenotipo expresa ojos oscuros pero posee el gen para ojos claros)