Le Docteur Eggman (alias Docteur Robotnik et de son vrai nom  Ivo) est l'ennemi de la plupart des aventures de Sonic.Il a un QI de 300 et 40 ans. C'est un inventeur fou qui transforme les animaux en robots. Il est le petit-fils du Professeur Gerald Robotnik, le créateur de Shadow. Il a perdu tous les membres de sa famille (Gérald Robotnik, son grand-père, et Maria Robotnik, sa cousine) il y a 50 ans, tous assassinés par le GUN, les forces armés des Fédérations Unis. Il rêve d'un empire totalitaire à son effigie : Eggmanland. Au début, il choisit de le créer sur des îles (South Island, West Side Island, Angel Island, Flickies Island) avant de vouloir conquérir des métropoles humaines (Station Square, Central City, Soleanna...). Au début de sa conquête, il utilise uniquement ses robots et flottes spatiales pour conquérir la Terre mais rapidement, il sera mis en déroute par Sonic, le GUN, voire des extraterrestres. Du coup, il n'hésitera pas à avoir recourt des forces divines pour arriver à ses fins : Chaos, Dark Gaia, Time Eather... Hélas, certaines de ces créatures échapperont à son contrôle et il lui arrivera de s'unir à Sonic afin de les combattre.