Kingdom Hearts χ se desarrolla en un pasado lejano, antes de los otros juegos de la serie. El juego comienza antes de la legendaria Guerra de la Llave-espada, un conflicto provocado por las disputas entre los portadores de Llave-espada sobre la luz que creó el mundo, desencadenando una calamidad que transformó el mundo en lo que se ve en el resto de la serie Kingdom Hearts.[5]​[7]​ Antes de la guerra, un Maestro de Llave-espada conocido solo como Maestro de Maestros (Master of Masters) otorga un Libro de Profecías a cinco de sus seis aprendices, los Profetizadores (Foretellers), antes de desaparecer.
El libro tiene la capacidad de predecir e incluso manifestar objetos y personas del futuro, de los cuales los cinco Profetizadores se enteran de una profecía que predice la destrucción del mundo.

Para evitar esto, los Profetizadores usan sus libros para manifestar mundos futuros y derrotar a los Crueles que los infestan para juntar pedazos de luz, llamados Lux.

Cada Profetizador crea y lidera su propia temática "Unión" en torno a su ícono animal individual:

Unicornio, gobernado por el Maestro Ira
Serpiente, gobernado por la Maestra Invi
Leopardo, gobernado por el Maestro Gula
Zorro, gobernado por la Maestra Ava
Oso, gobernado por el Maestro Aced.
El personaje jugador, un portador de Llave-espada recién despertado, elige apoyar a una de las Uniones y trabaja para garantizar la supremacía de la facción elegida.[4]​[8]​