Os lo planteo:
1. Minerva es la contraparte romana de Atenea, diosa de la sabiduría y la guerra griega.
2. McGonnagall se llama Minerva.

Conclusión mía:
Lo más probable es que se llame así y ya está, pero como yo estoy loca pienso... ¿Y si McGonnagall es en verdad esa diosa y hace vida camuflada como humana en Hogwarts? ¿Y si se ha fundido con una humana como en las Crónicas de Kane?