Los niños descubrieron que el mundo Digimon era en realidad un mundo digital generado a través de las redes de computadora de la Tierra. Mientras tanto, Nanomon, quien una vez fue vencido por Etemon y sellado en la pirámide, negoció con los niños; sacarlo de allí por la localización de los dos últimos emblemas. Natsumi guiada por su habilidad, insistió en no aceptar el trato del digimon. Taichi se negó confiando en él, pero al final Nanomon utilizó a los niños para obtener su venganza. Cuando estuvieron cerca de ser vencidos, Nanomon escapó, llevándose a Sora y a Biyomon con él. Pero Taichi, atrapado por su miedo a la muerte, falló al capturarlo. Preocupada y frustrada por la cobardía y la estupidez de Taichi, Natsumi, guiada por la indicación de Koushiro, salió en busca de su hermana. Al final, ambas se encontraban desaparecidas. Y el grupo se encontraba desorientado.

Todos querían salvar a Sora y Biyomon, al mismo tiempo querían encontrar a Natsumi la cual desconocían su situación, pero...

—No hay más opción que esperar a encontrar el paradero de Nanomon— dijo Joe, Koushiro se encontraba en la base de datos de la estructuras con símbolos, estaba intentando hallar el lugar en el cual se encontraba el digimon enemigo.

—Taichi miró a Joe con frustración—¿Pero que pasaría si mientras esperamos Nanomon intente hacerle daño a Sora y haya capturado a Natsumi?—Yamato contestó mientras sostenía uno de los bollos de sus provisiones—El objetivo de Nanomon es vengarse de Etemon. Tal vez, si vencemos a Etemon primero, la deje libre—Pero perdimos antes de tiempo— interrumpió Mimi.

Takeru y los digimon ya estaban descansando, el arrepentimiento de Taichi le creaba un revoltijo de sensaciones por dentro—Si hubiese salvado a Sora aquella vez...Natsumi no se habría enfadado conmigo, y no tendría porque exponerse al peligro—Joe le animó—¡Deja de echarte la culpa tu solo! Nosotros también pudimos—Aún podemos hacer algo—interrumpió Yamato.

Mientras Koushiro ya había averiguado la localización exacta de Nanomon, Taichi se sentía arropado por sus compañeros, los cuales compartían los mismo sentimientos por sus dos amigas. Sin embargo...Nanomon estaba llevando a cabo su plan, la venganza guiaba su mente.

—Que...¿que es esto?— Sora se fijo en el metal que sujetaba sus tobillos y muñecas, intentó soltarse pero era imposible, dirigió su vista para ver a su compañera, la cual estaba en las mismas condiciones que ella, pero en la pared—¡Biyomon!—exclamó al verla—No te preocupes ella solo esta inconsciente—Nanomon encendió las luces, mostrando así su cuerpo que ya no se encontraba en la oscuridad— la necesito para que venza a Etemon—Sora sonrió con sarcasmo—Que pena que ella solo pueda digievolucionar con mi ayuda— él digimon sonrió con malicia, la chica tenía un mal presentimiento—No te preocupes, no te necesito, además e conseguido algo más valioso...—él digimon pulsó un botón haciendo que una especie de maquinaria se encendiese, al mismo tiempo pulsó otro el cual parecía ser una barra de color naranja, esta pasó desde la parte superior hasta la inferior del cuerpo de la chica— él botón que he presionado segundo es el que me permitirá desechar tu cuerpo cuando no seas necesaria, el primero funciona para desplazar objetos o esta vez personas...— entonces comenzó a reír, la cinta que estaba en el suelo trajo una gran plancha de metal— ¡¡Natsumi!!—él digimon sonrió— Tu hermana quiso salvarte, pero fue derrotada— soltó una carcajada maliciosa— ella tiene una habilidad interesante, he probado hacer una copia de ella, pero no ha reaccionado a ningún estimulo por lo que tendré que usar a la original—Sora sentía escalofríos ante el digimon—Eres...—No hace falta que me halagues una mente privilegiada como la mía, no necesita halagos—Sora apretó sus dientes con fuerza.

Mientras el grupo de niños elegidos se movilizaba combatiendo contra los enemigos, usando algunos como señuelo, de esta forma, Taichi, podría salvar a ambas chicas. Sin embargo, Etemon había entrado en escena.

—Esos chicos son muy insistentes— los botones tocados por los dedos de metal de Nanomon resonaban en la habitación— parece ser que encontraron el lugar—Entonces— dijo Sora mientras observaba a Natsumi, la cual estaba inconsciente junto a su digimon— esos impactos—Están teniendo una batalla ahí fuera— se escuchó un estruendo—algunos de los niños se han adentrado en la pirámide ¡pero no dejaré que interfieran!—Taichi— Sora observó el techo con preocupación.

—Diablos... parecen que ya nos descubrieron— dijo Taichi, Koushiro asintió.

Los chicos comenzaron a correr a través de los extensos pasillos de piedra, muchas de las secciones estaban bloqueadas, al entrar en una de ellas para adentrarse en la entrada de la parte inferior de la pirámide, donde se encontraban Sora y Natsumi -aunque no eran conscientes del paradero de la última-, Etemon surgió del techo superior con un fuerte estruendo.

—¡Los encontré díganme donde esta Nanomon!—Koushiro se colocó al frente de Taichi—¡Taichi-san! Tentomon y yo haremos lo posible para retenerlo ¡Vayan!— él digivice de Koushiro comenzó a emitir su luz y sonido—¡Cuídate Koushiro!— gritó Taichi mientras corría junto a Agumon—¡Esperen!— se escuchó la molesta voz de Etemon pero Kabuterimon lo bloqueó con su cuerno.

Taichi continuó corriendo junto a Agumon hasta llegar a la gran barrera de su cobardía, la red electrificada. La misma que le impidió salvar a sus dos amigas. Las misma a la cual deberán enfrentarse. La observó con preocupación y atención. 

—Iré primero— dijo Agumon mientras se acercaba a la red, Taichi bloqueó su paso—Espera, Agumon—¿Qué?— preguntó confundido el digimon, Taichi comenzó a caminar—Yo iré— se acercó hasta la barrera—Hay una persona muy preciada para mí en el otro lado— miró con decisión la red— además... tal vez, ella también este al otro lado, ella... es importante para mí, no puedo dejarlas solas ¿cierto?—¿Qué?— preguntó Agumon—No solo es eso— negó con la cabeza mientras cerraba los ojos—Siento que ayer perdí algo realmente importante aquí—¡Tu puedes Taichi!— gritó Agumon, al ver la mano temblorosa de su compañero muy cercana a la barrera—¡Muestra tu coraje!—¡Ah!

Al gritar adentró su mano en su miedo, haciendo de esta manera que su mano encontrase el camino. Su emblema comenzó a brillar.

—¡Lo logré!— susurró mientras observaba su logro, Agumon alzó sus brazos—¡Genial!

Justo en ese instante Etemon apareció a través de las escaleras, junto al cuerpo de un derrotado Kabuterimon, Agumon digievoluciono. Taichi atravesó la barrera encontrándose con Nanomon y la copia de Sora - pero eso, él no lo sabía-.

—¡Sora!— exclamó al verla, pero un grito le interrumpió—¡Espera! ¡Esa no es Sora es una copia!—Taichi dirigió su mirada a una agarrotada Biyomon y a una atrapada Sora—He terminado de realizar la copia, si le entrego el dispositivo sagrado y el emblema se convertirá en la real—¡No lo permitiré!—gritó Taichi alzando su cuerpo en rescate del emblema, logrando así recuperarlos pero...

—¡Yo de ti no haría eso, niño elegido!— entonces el cuerpo de Sora que esta aprisionado se hundió en la oscuridad, pero Taichi logró salvarla. Aguantando su brazo con fuerza y dificultad, intentaba alzarla—Creo que te has olvidado de algo—Taichi le observó y palideció al instante, Natsumi estaba siendo ahogada por la copia de Sora—Te lo diré de una forma simple, para que un humano estúpido como tú pueda comprenderlo.

—Taichi chasqueó su lengua, mientras sujetaba con aún más fuerza el cuerpo de Sora—Si no me devuelves la Medalla y el Emblema la chica sufrirá, algo más que un mal momento—¡No serías— Taichi ahogó su voz en miedo—La mataré—¡No digas estupideces! ¡Vine a salvar a ambas! ¡No entregaré la vida de una por la otra y tampoco te daré el Emblema y la Medalla!— el rió con sarcasmo—¡Entonces ella morirá!— la copia de Sora aprisionó el cuello de la chica—Ta-taichi...—¡¡Natsumi!!— él castaño lanzó el Emblema y la Medalla hacia Sora, ella lo agarró—Natsumi— entonces el digivice de Sora brilló y sonó, trayendo a Birdromon al campo de batalla.

Natsumi fue rescatada y el grupo de cuatro junto a sus digimon salieron volando del lugar, encontrándose con los otros, los cuales estaban felices de verlos. Pero mientras tanto Etemon era absorbido por la oscuridad y venganza de Nanomon. Una especie de bola de cables en forma esférica parecía ser la armadura de Etemon. Se había vuelto más poderoso. Los niños se asustaron ante la temible presencia y posible poder del enemigo.

—¡Nanomon eligió morir por sí mismo, pero ahora es su turno!— gritó Etemon, sus ataques eran de gran poder, las zonas cercanas al grupo de niños parecían distorsionarse, creando en el aire unos grandes remolinos. Mientras los digimon intentaban defender a sus compañeros humanos y eran derrotados por su terrible fuerza. El pecho de Taichi comenzó a brillar, era el emblema. Agumon estaba sintiendo la valentía de Taichi.

—¡No dejaré que mis amigos sufran de nuevo! ¡No me rendiré!—él chico comenzó a correr junto a un digievolucionado Greymon, el cual estaba reaccionando ante el valor de Tai. Su emblema brilló y llegó el poder hasta el dispositivo haciendo que Greymon digievolucionase.

—¡Puedo sentir tu poder a través de mi cuerpo! ¡Puedo sentir tu valor!—¡MetalGreymon!— Taichi lo observaba con alegría, se sentía orgulloso por su digimon, esta vez era la digievolución correcta. Casi sin pestañear, el poder del nuevo nivel de Agumon destrozó por completo la superioridad de Etemon, pero uno de los remolinos de Etemon se llevó consigo a MetalGreymon y Taichi.

—¡Taichi!—gritó Sora, todos observaban al cielo -ya no distorsionado- , Natsumi miraba al cielo intentando no llorar. Habían perdido a Taichi.

Ahora los niños se encontraban temerosos. Habían rescatado a Sora y Natsumi, pero justo cuando volvían a reunirse deberían buscar a Taichi. Pero ahora, Natsumi estaba cerca de averiguar la verdad. Y los otros niños de encontrar el poder que haría que sus emblemas brillasen.