Erstmal eine Erklärung was Chakra so im generellem ist. Also hab ich mich mal im Internet schlau gemacht und zusammenfassend kann man es, denke ich mal, so sagen:

Das Wort "Chakra" kommt aus dem Sanskrit und heißt Kreis oder Rad. Chakra spielt in asiatischen Religionen eine Rolle und im Yoga. Laut Internet sollen z.B. Heiligenscheine und auch Kronen das Kronenchakra symbolisieren.

Chakra oder Chakren sind Energiezentren im Körper. Sie verbinden den physischen Körper mit dem Astralkörper. Von diesen Zentren gibt es sieben Stück die senkrecht in der Hauptachse positioniert sind. Jedes Chakra hat seine Position, Farbe und Aufgabe. Ebenso steht es, entsprechend seiner Aufgabe mit bestimmten Organen und Körperpositionen in Verbindung. Die sieben Chakren sind mit einem Kanal, dem Shushumna-Nadi verbunden. Man wird mit dem Chakra geboren muss es aber erst aktivieren.

So, das war die allgemeine Erklärung zum Chakra. Und ja, es ist mir bewusst, dass euch Chakra in Naruto ein Begriff ist. Und auch was es denn ist und wie essentiell es im Naruto Universum ist. Weil ohne Chakra nix mit Gen- und Ninjutsu.
Schließlich und endlich wird  ja in der Serie selbst erklärt was Chakra ist, das erste Mal von Sakura beim Baum klettern Training im Land der Wellen.

Das Chakra in Naruto basiert wahrscheinlich auf der allgemeinen Vorstellung von Chakra. Die, die mitdenken, oder denen es einfach so auffällt, ist klar das Chakra in Naruto nicht gleich Chakra in unserer Welt ist. Für die, die nicht mehr wissen was den nun Chakra in Naruto ist, hier eine Erklärung:
"Chakra wird modelliert aus Körperenergie und Geist-Energie. Je nach Jutsu muss man die einzelnen Komponenten verschieden stark verwenden."

Seinen Ursprung hat das Chakra in der Götterfrucht. Welche von Kaguya Ootsutsuki gegessen wurde und so an ihre Söhne weitervererbt hat. Nur aufgrund dem kommen wir nicht zur Tatsache, dass nach aktuellem Stand, so gut wie jeder Chakra besitzt. An dieser Stelle kommt dann Kaguyas erster Sohn Hagoromo zum Zug. Er ist umher gereist um den Schaden, den er im Kampf gegen seine Mutter, verursacht hat wieder gut zu machen. Dabei hat er dann auch das Chakra an seine Anhänger verteilt. Und die haben es auch ihren eigenen Kindern weitervererbt. Das Chakra selbst ist somit ein enormes Mutagen an sich. Heißt es muss einen extrem starken Einfluss auf DNA selbst haben. Soweit, dass es das Erbgut verändern kann. Oder aber das Chakra selbst, liegt einer in sich selbst geschlossenen DNA-Sequenz zugrunde. Ich weiß klingt kompliziert, meint aber einfach nur das Chakra eine DNA/RNA für sich haben könnte. Kommend vom Chakrabaum an sich, und hat sich anschließend in das Ergbut von Kaguya integriert. Was eigentlich eine Fähigkeit ist, die man so von Bakterien kennt. Jetzt kann man denken das dieser Gentransfer etwas ist was Kaguya einfach so kann, da sie selber ja eine Außerirdische ist. Und als Halbaußerirdischer kann Hagoromo dann seinerseits Chakra an andere weitergeben. Dieses Chakra weitergeben ist sehr wahrscheinlich etwas was er eben seiner Abstammung wegen kann, sonst könnte man ja Rock Lee sehr einfach Chakra geben.

Nun haben wir geklärt woher das Chakra in Naruto denn überhaupt her kommt.

Also kommen wir zu ein paar physischen Fakten:
Das Chakra im Körper des Shinobi fließt in einen eigenen Kreislauf, die Chakrabahnen werden Keirakukei genannt. Dieser Kreislauf hat dann auch noch Öffnungen, die Tenketsu.

Noch zu wissen ist auch, dass jede Zelle Chakra hat und durch dieses mit benachbarten Zellen verbunden ist.
Nun schmiedet der Shinobi seine jeweiligen Energien um so Chakra zu erzeugen. Wie viel ihm dabei zur Verfügung steht ist sehr wahrscheinlich auch genetisch veranlagt, da es Clans gibt die sehr hohe Chakrareserven habe.
Konzentriert wird die jeweils benötigte Chakramenge nun durch konzentrieren auf das Chakra. Die Kontrolle muss der Shinobi erst erlernen, wofür eigene Übungen erstellt wurden. Die erste Übung ist das Baumklettern. Es ist der erste Schritt in Richtung Chakra-Kontrolle, da die verwendete Chakramenge konstant ist um auf den Baum zu klettern, da der Baum als ruhiger Untergrund sehr gut ist, aber dennoch auf verschieden stark konzentriertes Chakra reagiert indem sich die Rinde unter absplittert bei zu hoher Chakramenge. Ein weiterer Vorteil ist wahrscheinlich das man seinen Fortschritt in die Baumrinde einritzen kann, was einen motivierenden Einfluss hat. Der nächste Schritt ist dann das Stehen auf dem Wasser. Dieser Schritt ist schwieriger, da man die verwendete Chakramenge immer wieder neu anpassen muss, da das Wasser in ständiger Bewegung ist.
Chakra wird aber auch Mithilfe der sogenannten Fingerzeichen konzentriert und so auch in ein jeweiliges Jutsu umstrukturiert. Aber genauer darauf eingehen werde ich später noch.

Nun zu den einzelnen Komponenten: Körper- und Geist-Energie.

Was Körperenergie ist, ist ja eigentlich recht simple. Einfach physikalische Gesetze im Kopf behalten. Vor allem die drei Hauptsätze der Wärmelehre.
Also ist Körperenergie die Energie die der Körper durch ständige innere Prozesse erzeugt. Prozesse wie die Verdauung, Atmung, Herzschlag ect. Diese Prozesse halten uns warm. Genauso wird Energie erzeugt, wenn der Körper sich bewegt. Das wäre dann die Energie der Bewegung.
Das heißt also das man aus Bewegung und Wärme Energie erzeugt. Diese vom Körper erzeugte Energie kann man dann wiederum zum schmieden des Chakras verwenden.
Dieser Vorgang der Energieerzeugung erklärt sicher auch warum Shinobis in ständiger Bewegung sind. Und warum sie auf ihren Missionen immer rennen, anstand durch langsamere Fortbewegungsmethoden Kraft und Energie zu sparen.

Recht simple alles, bis hier hin.

Die Geist-Energie bereitet mir ehrlich gesagt schon eher Schwierigkeiten mit dem herleiten und erklären. Aber daran soll es nicht scheitern. Ich würde mal so spontan auf die Psyche und all das voraus sie Einfluss nimmt tippen. Aber mir erscheint das nicht ganz so einfach. Mir kommt es so vor als ob die Geist-Energie von woanders herkommt, oder wenigstens nicht nur aus menschlicher Psyche herzuleiten ist. Schließlich können herauf beschworene Tiere genauso Chakra verwenden wie Menschen.

Geist-Energie könnte aber auch so etwas wie die Aura der Person sein. Oder dessen Seele und somit quasi die physische, also Köper-Energie, der Seele. Was dann auch Sinn macht mit dem Edo-Tensei Jutsu als solches. Da man hierbei ja die Seele des Verstorbenen wieder zurück bringt.

Wenn wir davon ausgehen das die Geist-Energie, die Körperenergie des Seelenkörpers ist, muss die Erzeugung dieser Energie den gleichen, oder zumindest ähnlichen, Prinzipien wie die Erzeugung der Körperenergie zugrunde liegen. Also durch Bewegung und Wärme wird Energie erzeugt.

Bloß wie kann ein nicht physischer Körper Wärme erzeugen? Hier wäre ich wieder beim Thema Psyche. Das eigene Bewusstsein, und auch Unterbewusstsein, muss eng mit der eigenen Seele/Aura verbunden sein, um diese Energie überhaupt erzeugen zu können, da das Eine nicht arbeiten kann ohne das Andere. Ich kann mir vorstellen, dass die Wärmeenergie der Seele durch Emotionen erzeugt wird. Was in Bezug auf das Erwecken des Sharingans durchaus Sinn macht.

Falls ihr Leser aber weitere Ideen habt, für eine Erklärung des Oben genannten, so bin ich immer offen für eben jene.

Nun da wir den Ursprung und die Entstehung des Chakras erklärt haben, kommen wir zum Chakranetzwerk als solchem.

Vergleichbar wäre das ganze System irgendwie zum Lympfsystem. Dieses hat zwar keine Öffnungen wie das Chakra Netzwerk, konzentriert sich aber dennoch in Knoten und die Tenketsu (die Chakraöffnungen) erinnern mich schon ein wenig an Lymphknoten. Auch weil die Lymphe ihr eigenes Fließsystem hat. Außerdem umspült die Lymphflüssigkeit jede Zelle, ist somit wie das Chakra mit jeder Körperzelle verbunden. Im Gegensatz zur Lymphflüssigkeit, ist das Chakra aber eine Verbindung zwischen den Zellen und agiert wahrscheinlich auch als Signalweg zwischen den einzelnen Körperzellen. Da Chakra in Sekundenschnelle konzentriert werden kann, gehe ich davon aus das die Signalleitung der Chakrafäden ähnlich schnell ist wie jene der Neuronen/Nervenzellen. Und wie schnell jene Zellen arbeiten ist den meisten denke ich klar. Und wenn nicht, werft einen Ball in die Luft und fangt ihn wieder auf. Macht euch dabei bewusst, das Neuronen das Signal "Ball werfen" an das Gehirn senden, gleichzeitig die Nerven der Augen den Ball und seine Laufbahn verfolgen, diese Information ebenfalls an das Gehirn leiten. Das Gehirn berechnet nun wohin die Hand bewegt werden muss und schickt dieses Bewegungssignal über die Nerven wieder an die Hand die den Ball anschließend fängt. Und jetzt rufe dir in Erinnerung wie lange der ganze Vorgang den nun dauert.

Genau, sehr schnell. So schnell ungefähr fließt wahrscheinlich das Chakra in seinen Bahnen. Was auch notwendig ist in Anbetracht der Tatsache wie schnell verschiedene Jutsus hintereinander eingesetzt werden.

Bloß sollte man Chakra und Neuronen nicht als was gleiches betrachten. Da Nerven ein eigener Zelltyp des Körpers sind und Chakra jedoch Energie die in jeder Zelle vorhanden ist. Auch in Nervenzellen. Das oben genannte Beispiel dient zum Verständnis der Geschwindigkeit des Chakraflusses, ohne jedoch zu sehr ins Detail einer Signalweiterleitung einzugehen. Denn das würde definitiv den Rahmen des ganzen sprengen, glaubt mir das, ich hatte eine komplette Vorlesungseinheit über Nervenzellen, und von den ganzen verschiedenen Signalwegen gar nicht erst zu reden.

Was das Chakra aber mit Neuronen und/oder dem Lymphsystem gemeinsam hat ist wohl ihre Notwendigkeit. Ohne Chakra stirbt die Person. Und ohne funktionierende Nerven wird ein Baby gar nicht erst geboren, und werden sie später geschädigt so führt das zu gravierenden Problemen. Und ohne Lymphe ist man sehr wahrscheinlich ebenfalls nicht lebensfähig.

Aber was ist mit jenen die ohne Chakra geboren wurden?
Die Frage ist, haben jene tatsächlich kein Chakra oder ist es einfach nur in so geringen Mengen vorhanden ist, das niemand dessen Existenz nachweisen kann, und es somit so scheint als ob es eben nicht da wäre. Ist tatsächlich kein Chakra vorhanden so hat sich eine Gensequenz über etliche Generationen erhalten, da diese Sequenz noch aus der Zeit von Hagoromo selbst kommen muss.

Zusammenfassend kann man also sagen, das das Chakra ein drittes System im Organismus bildet das notwendig für das Überleben des Organismus ist. Durch Übung und Training ist man in der Lage das Chakra zu kontrollieren und zu beeinflussen. Um Chakra zu beeinflussen muss man mit der Veranlagung es zu besitzen geboren werden. Dementsprechend sind jene Personen ohne Chakra eigentlich jene die "normal" sind, da ihre DNA nicht einer solchen drastischen Mutation unterlag.

Ich denke ich habe nun alles wichtige erwähnt und nieder geschrieben. Für Unklarheiten einfach bei mir melden und ich hoffe jetzt einfach mal, das man meine Gedankengänge nachvollziehen kann.