1. Phương pháp cấy truyền và bảo quản lạnh

- Nguyên tắc: dựa trên sự trao đổi chất theo một khoảng thời gian nhất định.

2. Phương pháp bảo quản trong đất hoặc cát

- Nguyên tắc: làm giảm độ ẩm của đất hoặc cát sau khi vô trùng. Độ ẩm thấp làm giảm khả năng hô hấp của VSV và như vậy sẽ bảo tồn được tính trạng quan tâm.

3. Phương pháp bảo quản giống trong hạt ngũ cốc

- Nguyên tắc: nuôi các VSV trực tiếp trong hạt ngũ cốc đã hấp chín. Phương pháp này thường thích hợp cho các loại nấm sợi, có thể thay thế bằng các loại bột (vd: bột mì)

4. Phương pháp bảo quản giống trong lớp dầu

- Nguyên tắc: cách ly VSV khỏi không khí và như vậy sẽ hạn chế tối đa quá trình hô hấp của VSV, bảo quản được trong thời gian dài.

5. Phương pháp bảo quản giống theo phương pháp đông khô

- Nguyên tắc: giảm độ ẩm của canh trường nuôi cấy (trong đó có sinh khối giống VSV) ở nhiệt độ thấp trong điều kiện chân không.