Quá trình khoáng hóa: là quá trình phân hủy xác hữu cơ dưới tác động của quần thể vi sinh vật thành các chất khoáng hòa tan hay các chất khí và tỏa nhiệt,tùy thuộc điều kiện khoáng hóa mà cho sản phẩm khác nhau.Trong đk háo khí,CHC phân hủy thành các sản phẩm :các HCHC có đạm(NH4+,NO3-), các HCHC chứa S(SO42-), HCHC chứa P(PO43-...).trong đk yếm khí,CHC tạo ra một lượng lớn các chất khử(CH4, H2S ,NH3, N2...).Ngoài ra nó còn mang lại một nguồn năng lượng cho đất dưới dạng nhiệt năng.

Quá trình này phụ thuộc vào số lượng vi sinh vật,chủng loại vi sinh vật,đk thích hợp:nhiệt độ,độ ẩm,pH...

*)Quá trình mùn hóa: Bản chất của quá trình này là quá trình phân giải xác hữu cơ do hệ VSV phân giải,tạo nên các hợp chất trung gian và tổng hợp các hợp chất trung gian đó thành các HCHC phức tạp gọi là mùn.

Quá trình hình thành mùn được thực hiện theo 3 bước:

+Các HCHC phức tạp (protid,lipid,ligin...)được phân giải thành các sản phẩm trung gian

+Dưới tác động tiếp theo của VSV,tổng hợp các HCHC trung gian tạo thành các lien kết hữu cơ phức tạp,có nhân vòng thơm,mạch nhánh với các nhóm định chức.

+Các lien kết hữu cơ phức tạp này được các VSV tổng hợp trùng ngưng lại thành cá HCHC cao phân tử như những chuỗi xích bền vững.

Khi đó sẽ hình thành hợp chất gọi là mùn