Après la cinématique du début qui se déroule dans le village de Toad, vous regagnez le contrôle de Mario et Luigi dans le château de Peach. Avancez au nord et entrez dans la zone suivante. Récoltez des pièces dans les quatre coins du jardin et entrez dans le palais.

Sauvegardez le jeu grâce au cube lumineux, récupérez une pièce à gauche et entrez par la droite. Après la discussion, effectuez le tutoriel et apprenez à combattre en affrontant Bowser.

Une fois que vous aurez maitrisé les attaques sautées, une autre discussion se déclenche puis vous regagnez le contrôle de Bowser.

Avancez au sud, détruisez les roches grâce à un coup de poing et poursuivez à nouveau vers le sud. Utilisez le souffle de feu pour bruler les trois arbres et allez à droite. Avancez légèrement jusqu'à ce qu'une discussion se déclenche et vous incarnerez à nouveau Mario et Luigi.