AfterGenocide diễn ra sau khi Chara cảm thấy chán nản
Chỉ có 3 cái kết và cô chỉ có thể giết từng ấy người
Thế nên, lần này sẽ khác.
"Này ông già, ông có bao giờ nghĩ đến viễn cảnh tôi thoát ra khỏi đây chưa?"
"Huh?"
Quy Luật của hệ thống đang bị nứt vỡ, Quy Luật của hệ thống đang bị phá hủy. Sau khi tiêu diệt Sans, Chara tiến đến và thẳng tay giết asgore trước khi flowey kịp đến. Cô hấp thụ 7 linh hồn còn lại và hoàn toàn tha hóa linh hồn của frisk, sau đó cô đã được hồi sinh. Một linh hồn mới, một loại linh hồn hoàn toàn mới. R-Souls thứ linh hồn mà Gaster đã từng cố gắng nghiên cứu trước đây nhưng chỉ đi vào ngõ cụt, Chara đã có đủ sức mạnh để tiến lên thế giới loài người và bắt đầu cuộc diệt chủng tàn khốc hơn. Nhưng vì hành động của cô, một dị điểm đã mở ra.
Một dị điểm được mở ra lần đầu tại hotland, ở cỗ máy năm xưa gaster từng xây. Đó là lối dẫn vào Void, chiều không gian kết nối với tất cả timeline. Những dị điểm dần mở ra nhiều hơn ở underground, và khi nó xuất hiện ở judgement hall, Gaster đã cảm nhận được. Sự sống thoi thóp đến từ linh hồn của Sans, tạo vật.. À không con trai của ông, Gaster nhanh chóng sử dụng magic kéo Sans lại gần mình. Đã rất lâu rồi, và ông rất hối hận vì sự cố năm xưa mà để hai anh em lại một mình.
"Con vẫn không ngừng tìm cách đưa ta trở lại nhỉ, cái cỗ máy sau nhà ấy. Ta hoàn toàn biết chứ"
Gaster vừa nói vừa cho Sans hấp thụ soul của mình, thứ giờ đây đã hợp nhất với void. Đây là thứ duy nhất ông có thể làm cho cậu hiện tại.
"Sans, ta biết con nghe thấy được, ta xin lỗi. Nhưng ta chỉ có thể làm như này thôi, đây là sứ mệnh của con. Con là hi vọng duy nhất để con quái vật đấy không thể phá hủy thêm, hãy luôn nhớ điều đó. Trách nhiệm càng cao thì sức mạnh tìm đến con sẽ càng mạnh". Sans tỉnh dậy, "gì cơ không thể nào, mình vẫn sống?". Khung cảnh xung quanh là một judgment hall đổ nát đầy rêu xanh, ánh mặt trời chiếu rọi vào mắt anh ta. Ngọn núi và bề mặt underground, đã bị thứ gì đó san phẳng. Anh ta cảm thấy bản thân hơi khác, anh ta cao hơn. Có gì đó lạ ở mắt anh ta, trang phục cũng đã thay đổi. Anh ta cảm nhận được sự hiện diện của ai đó bên trong, anh ta từ từ đứng dậy. Dịch chuyển đến quán grillby, giờ đây nơi này cũng đổ nát, snowdin town cũng không còn tuyết. Tiếng la hét của toàn bộ thế giới ập vào đầu Sans, anh ta ngã xuống ôm đầu quằn quại trong cơn nhức đầu tột độ. Anh nhớ ra việc mình cần làm, hình ảnh Chara hiện lên trong đầu. Giờ đây anh quyết định gọi bản thân với cái tên mới, Santers The Savior From Hell. Anh ta bắt đầu chuyến hành trình đi tìm chara của mình, vừa đi vừa làm chủ thứ sức mạnh hoàn toàn mới này. Địa điểm đầu tiên là New York, nơi này hiện tại chẳng còn một bóng người thành phố thì gần như bị thổi bay. Thứ duy nhất còn tồn tại ở đó, là những sinh vật sinh ra từ linh hồn của những con người đã chết. Chúng đại diện cho nỗi sợ, nỗi lo, cảm xúc cũng như là chính cái chết, Santers đã phải đối đầu với một con. Anh ta gọi chúng là Soul-E, nó lao vào Santers với tốc độ chóng mặt. Anh ta có thể dễ dàng né được, anh ta nhận ra mọi thứ mà nó chạm vào. Đều sẽ chết đi và phân hủy, Santers triệu hồi xương và blaster để tấn công nhưng chúng quá nhanh. Anh ta cũng không thể làm gì linh hồn của chúng, và rồi con mắt trái của anh ta bắt đầu chảy ra những chất dịch có tên gọi là corrupted determination. Một con mắt mới được nâng cấp, giúp anh có thể thấy trước tương lai tùy ý muốn cũng như nhìn thấy những thứ mà không ai thấy được. Khi kích hoạt thì nó cũng giúp anh tăng tốc độ lên rất nhiều, Santers đã có thể dễ dàng đoán được bước đi của con quái vật và bẫy nó. Santers đã đánh bại Soul-E.
Santers nhận 1789exp và 55 gold. Có vẻ như hệ thống giờ đã áp dụng lên chính anh, Santers đã lên lv2, anh ta bắt đầu đi tiếp đến bãi biển gần đấy. Hi vọng sẽ không gặp bất cứ thứ gì nguy hiểm hơn.

"Ta sẽ trở lại đưa mấy đứa đi sau, sau khi tìm được một nơi thật sự tốt. Sẽ sớm thôi đừng lo".
Santers cõng theo đứa trẻ, anh ta hỏi tên cô bé nhưng dường như cô bé không trả lời. Vì.. Nhóc khát ư? Hay đói?
"Hay nhóc đã gặp chuyện gì đó không tốt đẹp". Cô bé lắc đầu và chỉ về một hướng, Santers không nghi ngờ gì và đi theo. Đã vài ngày trôi qua, trước mặt anh là một căn nhà gỗ ở ngoại ô. Trông nó từng rất ấm cúng, cô bé chạy vào trong và đứng nhìn về phía 2 bộ xương. "Đó là cha mẹ nhóc đúng không, ta rất tiếc..", vào lúc Santers không để ý thì cô bé chạy đi tìm thứ gì đó. Trong đống đổ nát, một sợi dây chuyền dường như nó đã mất thứ gì đó, và một bức ảnh. Cô bé tên là Chloe, cuộc sống của cô bé từng rất bình yên cho đến khi...
Có vẻ như Chloe không còn vương vấn gì trong lòng nữa. Cô bé rất dũng cảm không rơi một giọt nước mắt nào, Santers tìm được một tấm bản đồ từ trong nhà kho và cùng cô bé tiến ra biển. Nơi anh ta sẽ tìm đường để đến châu âu.