- Omesso il dettaglio in cui Harry, Ron ed Hermione, svolgendo le pulizie insieme alla signora Weasley presso Grimmauld Place, ritrovano ignari il Medaglione di Serpeverde.

- Non viene rappresentato l'elfo Kreacher come "traditore" di Sirius Black.

- Non compaiono i personaggi di Rita Skeeter e di Marietta Edgecombe.

- Nel film viene omessa la sfuriata di Harry contro Ron e Hermione (che non avevano dato loro notizie per tutta l'estate) a Grimmauld Place.

- Viene vista Cho come la persona che ha dato alla Umbridge le informazioni riguardanti l'ES mentre nel libro è la sua amica Marietta Edgecombe.

- Nel libro chiunque tradisca l'ES viene punito con la comparsa di orrende bolle sul viso disposte in modo da formare la parola "spia", grazie ad una fattura di Hermione sul foglio di iscrizione dell'ES; questo particolare è stato ignorato nel film.

- Non viene detto che Harry vuole parlare con il suo padrino dopo l'esperienza del Pensatoio, né che riesce ad intrufolarsi nell'ufficio della Umbridge e ad usare la Polvere Volante.

- Omesso il fatto che è stata Dolores Umbridge a mandare i Dissennatori da Harry all'inizio del film.

- Omesso che Ron ed Hermione diventano Prefetti all'inizio dell'anno.

- Omesso il Quidditch e il fatto che Ginny è diventata la nuova Cercatrice dopo che la Umbridge interdice a vita Harry e i gemelli dallo sport, omessa anche la parte in cui Ron diventa portiere e che all'inizio è un po' impacciato, ma che durante l'ultima partita fa vincere la coppa di Quidditch ai Grifondoro.

- Viene omessa la sequenza del San Mungo, dove i ragazzi incontrano Gilderoy Allock e vedono i genitori di Neville resi folli dalla Maledizione Cruciatus inflittagli da Bellatrix Lestrange. Viene però introdotta la storia dei signori Paciock prima di una lezione dell'ES.

- Nel film è Sirius a consegnare ad Harry la foto del primo Ordine della Fenice alla stazione di Londra, mentre nel libro è Malocchio Moody, nel rifugio dell'Ordine della Fenice.

- Nel film è Luna Lovegood a spiegare ad Harry cosa sono i Thestral, mentre nel libro è Hagrid, durante una lezione di Cura delle Creature Magiche.

- Il film fa credere che la rottura tra Cho e Harry avvenga a causa del tradimento di Cho verso l'ES, mentre nel libro è la rabbia di Harry verso l'amica di Cho, Marietta, e l'incompatibilità tra i caratteri dei due personaggi.

- Omessa la Strillettera, spedita da Silente, ricevuta da Petunia che ordina di far rimanere il ragazzo al sicuro in casa (promessa che giurò di mantenere anni prima) e i gufi spediti da Sirius e dal Signor Weasley dicendogli di rimanere a casa.

- Viene fatto pensare che Neville Paciock non sappia vedere i Thestral, mentre nel libro ha questa capacità.

- Nel duello all'Ufficio Misteri, la profezia cade di mano a Lucius Malfoy e si rompe. Mentre nel libro a rompere la profezia è Neville Paciock.

- Nel film, Neville trova la Stanza delle Necessità in cui si svolgeranno poi le riunioni dell'ES. La funzione della Stanza è poi spiegata da Hermione. Nel libro, invece, Harry ne sente parlare la prima volta brevemente da Silente al quarto anno, ma è Dobby (assente in questo film) a rivelargli dov'è e la sua funzione.

- Nella scena in cui Hagrid rende nota ai ragazzi l'esistenza di Grop, nel libro sono presenti solo Harry e Hermione, in quanto Ron è impegnato in una partita a Quidditch.

- Omesso l'articolo sull'intervista a Harry scritto da Rita Skeeter e pubblicato sul Cavillo. Inoltre non viene menzionato il fatto che il padre di Luna è il direttore del giornale.

- Nel film, è Hermione ad accorgersi per prima delle scritte col sangue subite da Harry con la Umbridge, per punizione; nel libro è Ron a scoprirlo.

- Nel film, Harry insegna la fattura Levicorpus alle riunioni dell'ES e Luna la usa durante la battaglia al Ministero. Nei libri però Harry viene a conoscenza della fattura Levicorpus solo nel sesto libro, attraverso il libro di pozioni del Principe Mezzosangue.

- Nel libro, Neville risulta essere, contro ogni aspettativa, il migliore dell'ES; nel film, invece, si mostra impacciato come sempre.

- Nel film, Ginny diventa abile a lanciare l'incantesimo Reductor, mentre nei libri il suo incantesimo più potente è la fattura Orcovolante.

- Nel film Sirius muore a causa della maledizione Avada Kedavra inflittagli dalla cugina Bellatrix Lestrange; nel libro Bellatrix lo uccide lanciandogli uno schiantesimo che lo colpisce in pieno petto mandandolo a cadere dietro il velo appesa all'arco.

- Nel libro, Harry ascolta la profezia da Albus Silente dopo la battaglia all'Ufficio Misteri, mentre nel film riesce a sentirla nell'Ufficio Misteri, prima che venga distrutta.

- Nel film, il peggior ricordo di Piton viene ristretto a una banale angheria da parte del padre di Harry e dei sui amici, e viene completamente omesso il ruolo di Lily Evans nella vicenda.

- Nel film non vengono messe in evidenza le continue frustrazioni di Harry e il suo rapporto con i suoi compagni, mentre viene solo citato un abbozzo di litigio fra lui e Seamus Finnigan a inizio anno.

- Nel film viene omessa la sfuriata di Harry (sconvolto dalla morte di Sirius) contro Silente, nell'ufficio del preside, dopo le vicende nell'Ufficio Misteri.

- Nel film Harry riceve solo una volta la punizione dalla Umbridge, mentre nel libro la riceve più volte.

- Omessa la parte in cui Fiorenzo diventa il nuovo insegnante di Divinazione in quanto la Cooman viene licenziata.

- Non viene menzionato che la Cooman durante il primo incontrò con Silente rivelò la profezia tra Harry e Voldemort.

- Viene tolta nel film la maggior parte delle stanze che si trovano al ministero e la lotta tra i ragazzi contro i Mangiamorte.

- Silente nel film (durante la scena del ministero) appare solo alla fine, mentre nel libro combatte contro i Mangiamorte.

- Viene omessa la parte in cui Silente incanta delle statue per bloccare Harry e Bellatrix (che nel film fugge, mentre nel libro resta per tutta la battaglia tra Silente e Voldemort, anche se non è in grado di muoversi).

- Nel film non è citata la parte in cui la Umbridge irrompe nella casa di Hagrid e cercano di rapirlo (ma egli riesce a fuggire) e inoltre non è citata (sempre nel film) la parte in cui la McGranitt riceve quattro fatture dagli scagnozzi della Umbridge e viene ricoverata al San Mungo.

- Nel film si vedono i membri dell'Ordine della Fenice arrivare al Ministero, ma non è chiaro come.