- All'inizio del film è presente un personaggio inesistente nel libro, una ragazza, cameriera in un fast-food a cui Harry chiede di uscire.

- Per una maggiore fluidità, l'ordine cronologico tra il Voto Infrangibile stretto da Piton con Narcissa Malfoy e l'arrivo di Harry alla Tana è stato modificato.

- Non si fa accenno al fatto che Harry sia erede di Sirius Black, il quale gli ha lasciato tutti i suoi averi, tra cui la casa di Grimmauld Place e l'elfo domestico Kreacher.

- Nel libro è Ninfadora Tonks a trovare e a curare il naso di Harry dopo l'aggressione di Malfoy sul treno, mentre nel film è Luna Lovegood.

- Nel libro, quando Harry va nella stanza delle Necessità per ricordarsi dove ha messo il libro del Principe Mezzosangue mette un busto di donna con sopra una parrucca bianca con sopra il diadema di Corvonero, ma che nel film non è presente. Al contrario, nel film è Ginny, entrata con lui nella stanza, a nascondere il libro così che Harry non sia tentato di recuperarlo in seguito. Nel film inoltre, sono gli amici di Harry, Ginny in particolare, a convincerlo a liberarsi del libro, mentre nel romanzo Harry nasconde il libro per non farlo trovare da Piton.

- Nel film, Ginny bacia Harry nella Stanza delle Necessità, mentre nel libro i due si baciano per la prima volta nella sala comune dei Grifondoro, dopo una vittoria a Quidditch, alla presenza di tutti.

- Nel libro, Madama Rosmerta dà la collana stregata alla ragazza, l'idromele avvelenato a Lumacorno e avvisa Malfoy della partenza e del ritorno di Silente dalla caverna, tutto questo a causa della maledizione Imperius a cui era stata sottoposta da Draco Malfoy, mentre nel film per semplificare la comprensione è tutta opera di Malfoy in prima persona.

- Nel film è evidente l'ossessione che Harry ha nei confronti di Draco Malfoy. Nel libro però è talmente ostinato nello scoprire cosa abbia in mente da chiedere agli elfi domestici Dobby e Kreacher di pedinarlo costantemente.

- Harry, sul treno per andare alla Tana per le vacanze di Natale, racconta a Ron di aver ascoltato la conversazione tra Piton e Malfoy e di aver sentito parlare del Voto Infrangibile, mentre nel libro è proprio alla Tana che Harry confessa ciò.

- Nel film, già a Natale si fa capire della presenza di una relazione tra Lupin e Tonks. Nel libro lo si rende palese in Infermeria, solo dopo la morte di Silente. Inoltre non vengono espressi i problemi che sorgerebbero in tale relazione, e di conseguenza il motivo del cambiamento di Tonks (il colore dei capelli e il Patronus) e l'inquietudine di Lupin.

- Nel film, Arthur Weasley parla a Harry degli Armadi Svanitori. Questa scena non è presente nel libro, come i tentativi di Draco di collegare l'Armadio Svanitore di Hogwarts con quello di Magie Sinister.

- L’attacco alla Tana non è presente nel libro.

- Nel film Harry va alla capanna di Hagrid solo sotto l'influenza della Felix Felicis, mentre nel libro è Hagrid stesso che lo prega (tramite una lettera) di prendere parte al funerale di Aragog. Inoltre Harry non assume l'intera boccetta di pozione, ma ne avanza una parte che sarebbe stata usata dai suoi amici nello scontro con i Mangiamorte alla fine del libro.

- Nel libro, Harry e Silente analizzano diversi ricordi nel Pensatoio, con i quali si presentano al lettore alcuni elementi rilevanti ai fini della narrazione mentre nel film i due ne analizzano solo alcuni.

- Nel film, Harry assiste parzialmente ad un colloquio tra Piton e Silente che, dal punto di vista narrativo, si colloca invece nel 7° libro, con la rievocazione di un ricordo, mentre nel sesto libro il colloquio viene riportato a Harry da Hagrid. La presenza di Harry, inoltre, non è contemplata nel libro. In più la scena che verrà vissuta da Harry attraverso i ricordi nel Pensatoio, non si svolge nella Torre di Astronomia, ma nei pressi della Foresta Proibita.

- Nel film sono stati omessi dettagli sul passato di Piton, il motivo per cui si sia definito "il Principe Mezzosangue" e le motivazioni della fiducia in lui riposta sia da Voldemort che da Silente.

- Nel film non sono presenti i combattimenti finali tra Mangiamorte e gli studenti di Hogwarts ma sono soltanto le scene della distruzione della Sala Grande e la dimora di Hagrid.

- Nel libro, durante la battaglia ad Hogwarts, il lupo mannaro Fenrir Greyback morde Bill Weasley, sfigurandolo; nel film tale episodio non è presente.

- Nel libro, solo alla fine Malfoy spiega come è riuscito a far entrare i Mangiamorte ad Hogwarts. Nel film, invece, attraverso più scene si intuisce il piano di Draco.

- Nel film, Harry visita l'ufficio di Silente dopo la sua morte e tocca la sua bacchetta che nel romanzo dovrebbe trovarsi nella sua tomba.

- Nel film, nella scena della morte di Silente, questo chiede a Harry di non farsi notare e non intervenire, mentre nel libro fa nascondere Harry sotto il mantello dell'invisibilità e lo pietrifica, eseguendo la fattura proprio mentre Draco lo disarma, facendo volar via la bacchetta del preside, senza che questi possa difendersi.

- Nel film Draco Malfoy va da Magie Sinister con sua madre e con Fenrir Greyback, mentre nel libro ci va da solo.

- Nel film è omessa la parte in cui Cornelius Caramell (ormai vecchio ministro della magia) parla con il ministro dei babbani.

- Nel film non viene messo in risalto che Codaliscia si trova prigioniero a casa di Piton.

- Nel film è tagliata la conversazione di Silente con i Dursley, nel momento in cui va a prendere Harry.

- Non è presente nel film la parte in cui Silente parla con Harry nel ripostiglio delle scope fuori da casa Weasley.

- Nel film non viene raccontata la richiesta di Voldemort prima a Dippet (vecchio preside di Hogwarts) e poi a Silente, di diventare insegnante di Difesa contro le arti oscure, e non ricevendo il posto la maledizione che inflisse (ovvero che gli insegnanti di Difesa contro le arti oscure non restassero in carica più di un anno).

- Nel libro la professoressa Sibilla Cooman racconta a Harry che fu Piton ad origliare (e quindi in seguito a raccontare al Voldemort) la profezia che lei stessa aveva pronunciato (anche se non se ne accorse).

- Nel libro non si menziona la capacità di volare dei mangiamorte, anzi nel settimo tutti rimangono sorpresi nel veder volare Voldemort. Nel film invece riescono a farlo.

- Come spesso accade nel film Harry usa la magia fuori da scuola (nella casa di Horace Lumacorno ad esempio) mentre nei libri viene detto che non può farlo.