-All'inizio Harry legge il libro tramite l'incantesimo Lumos Maxima, il che non dovrebbe essere possibile poiché, come è risaputo, ai maghi minorenni non è permesso fare magie fuori dalla scuola visto che hanno addosso la traccia. Nel libro, infatti, Harry usa solo una pila.

- Nel film Zia Marge resta solo una serata prima di venire gonfiata da Harry, mentre nel libro resta dai Dursley per una settimana e viene gonfiata l'ultimo giorno. Inoltre, nel libro, dopo essere stata gonfiata, rimane attaccata al soffitto, mentre nel film vola fuori dalla casa e viene ritrovata vicino ad una ciminiera.

- Nel film nella scena del Nottetempo, Stan Picchetto chiede a Harry come si chiama e lui non lo dice, mentre nel libro invece, Harry dice di chiamarsi Neville Paciock.

- Nel film quando Harry scende dal Nottetempo, viene accompagnato da Tom, mentre nel libro incontra il ministro Cornelius Caramell.

- Nel film Harry incontra Ron e Hermione al paiolo magico, mentre nel libro li incontra a Diagon Alley, seduti al tavolo di una gelateria.

- Nel film la prima volta che compare Hermione, ha già in mano il gatto Grattastinchi, mentre nel libro va a comprarlo con Harry e Ron (anche se inizialmente doveva comprare un gufo), quando Ron doveva andare a prendere una medicina per Crosta.

- Nella scena del treno, dove sale il dissennatore, nello scompartimento ci sono solo Harry Ron e Hermione, mentre nel libro si aggiungono anche Neville e Ginny. Inoltre Remus Lupin nel film, si sveglia solo dopo che il dissennatore ha attaccato Harry, mentre nel libro si sveglia prima che il dissennatore entri nello scompartimento.

- La Signora Grassa non viene ritrovata da Pix, assente nel film, ma dal guardiano Argus Gazza.

- Non viene citata la sostituzione della tela della Signora Grassa (per un restauro) con quella di Sir Cadogan sul quadro per l'accesso alla sala comune dei Grifondoro.

- Nella film compaiono in due occasioni (sul Nottetempo e ai Tre Manici di Scopa) delle teste parlanti che nel libro non figurano.

- Nel libro, a differenza del film, non si esibisce il coro della scuola durante il banchetto d'inizio anno; avviene, invece, come tutti gli anni, lo Smistamento dei nuovi studenti, che però Harry perde, portato nell'ufficio della McGranitt da Madama Chips perché svenuto sul treno.

- Nel libro, Harry scopre che Sirius Black vuole ucciderlo ascoltando di nascosto una conversazione tra Molly e Arthur Weasley, mentre nel film glielo dice Arthur stesso.

- Nel romanzo Hermione, che segue più corsi di tutti i suoi amici finendo per essere molto stressata, ha un litigio con la professoressa Cooman, lasciando perdere definitivamente la sua materia. Nel film invece abbandona perché la Cooman gli dice che non possiede la ''vista''.

- Harry ascolta la profezia della Cooman che nel libro è formulata molto dopo, nel corso di un esame di Harry.

- Nel film viene tagliata la scena dove Sirius Black si infiltra nel dormitorio maschile della torre di Grifondoro e sembra che cerchi di colpire Ron con un coltello.

- Nel libro è il professor Lupin a leggere sulla mappa il nome di Peter Minus, mentre nel film è Harry.

- La Firebolt compare solo alla fine del film, mentre nel libro Harry la riceve come regalo di Natale: viene quindi del tutto tagliata la vicenda del libro in cui, sospettando che il regalo della scopa sia una mossa subdola del presunto delinquente Sirius Black per ferire Harry, viene consegnata alla professoressa McGranitt e fatta controllare dal professore Vitious e da Madama Bumb; nel film viene palesato che la Firebolt è un regalo di Sirius Black perché ha allegata una piuma di Ippogrifo, dettaglio del tutto in distonia con il libro.

- Nel film vengono tolti completamente tutti gli avvicendamenti che portano alla vittoria coppa di Quidditch, anche questa tolta completamente, vinta dai Grifondoro grazie ad Harry.

- La spiegazione di tutti i misteri nella Stamberga Strillante è ridotta a poche battute che, di conseguenza, omettono molti importantissimi particolari presenti nel libro.

- Una delle battute che Ron, eroicamente, fa nel libro mentre ha la gamba rotta e a fatica si regge in piedi ("Se vuoi uccidere Harry dovrai uccidere anche noi!") viene detta da Hermione.

- Nel film, dopo la scena della Stamberga Strillante, Piton si riprende dallo svenimento cercando di proteggere Harry, Ron ed Hermione da Lupin trasformato in lupo mannaro, mentre nel libro Piton si risveglierà molto dopo e non assiste alla trasformazione di Lupin.

- Nel lago, durante l'attacco dei Dissennatori, assieme a Sirius e Harry c'è anche Hermione, mentre nel film non è presente.

- Manca completamente la spiegazione della genesi della Mappa del Malandrino e quali identità si nascondono sotto Ramoso, Lunastorta, Felpato e Codaliscia; altra spiegazione omessa è quella relativa alla forma del patronus di Harry (un cervo).

- Quando Harry e Hermione entrano nella Stamberga Strillante, non vengono trascinati dentro dall'albero ancora in movimento, ma Grattastinchi preme una radice che lo blocca, e così per Lupin, che usa l'incantesimo Immobilus nel film.

- Nel libro, quando Lupin si trasforma in lupo mannaro, rincorre Harry ed Hermione, i quali si rifugiano nella casa di Hagrid; nel film, sono nella foresta proibita.

- Nel film i Dissennatori appaiono scheletrici con mantelli strappati, nel libro, invece, con grossi mantelli e grandi cappucci.

- Sono stati omessi tutti i litigi tra Harry e Ron con Hermione, a causa della Firebolt e della presunta morte di Crosta, che nel libro occupano interi capitoli e sono necessari ad evidenziare la crescita dei tre protagonisti. La sparizione del topo è banalizzata nel film ad un abbozzo di litigio solo con Ron.

- Quando Hermione e Harry tornano indietro nel tempo con la Giratempo, Ron dorme nel letto dell'infermeria e non si accorge di nulla. Nel film è, invece, sveglio.

- Nel film Harry va ad Hogsmeade solo una volta e sotto il mantello dell'invisibilità. Nel libro, invece, ci va la prima volta senza il mantello, passando attraverso la gobba della statua della strega Orba al terzo piano che si apre mediante l'incantesimo "dissendium" ed è proprio durante questa prima illegale escursione che ascolta, nascosto sotto un tavolo del pub (cui sono seduti Ron e Hermione, dietro un albero di Natale spostato da Hermione con un incantesimo), Madama Rosmerta, la McGranitt, il professor Vitious e Cornelius Caramell parlare del presunto tradimento di Black ai danni dei Potter e la storia di Peter Minus. Nel film, invece, il professor Vitious non è presente, Harry è nascosto sotto il mantello dell'invisibilità e Ron e Hermione non ci sono.

- Nel libro, inoltre, Harry torna ad Hogsmeade una seconda volta, sotto il mantello dell'invisibilità e lo fa passando di nuovo tramite la gobba della strega orba. In questa occasione, butta del fango addosso a Malfoy, Tiger e Goyle, ma per sua sfortuna il mantello rimane impigliato, scoprendo la testa di Harry. Malfoy denuncia l'accaduto a Piton, che intuisce che Potter sia andato illegamente ad Hogsmeade e lo rimprovera duramente. È in questa circostanza che Piton toglie ad Harry la mappa del malandrino (nel film lo fa mentre scopre Harry aggirarsi di notte nel castello) e, come nel film, Lupin lo salva da una dura punizione.

- Nel film non c'è nessun riferimento agli esami che i ragazzi devono regolarmente sostenere a fine anno e alla forma che assume il molliccio di Hermione: la forma della professoressa McGranitt che le comunica di essere stata bocciata in tutte le materie (paura che denota una forte insicurezza intrinseca da parte della ragazza).

- Nel film Grattastinchi ha un ruolo marginale, nel libro aiuta molto. Dato che non è un gatto qualunque, Grattastichi diventa alleato di Sirius. Grazie al gatto, infatti, Sirius riesce a recapitare la Firebolt per Harry il giorno di Natale e Sirius riesce ad entrare nel dormitorio di Grifondoro di notte con la parola d'ordine, parola che non avrebbe mai potuto conoscere se il gatto non avesse rubato dal comodino di Neville Paciock un foglietto con su scritte tutte le parole d'ordine della settimana.

- Inoltre, Piton entra nella Stamberga Strillante sotto il mantello dell'invisibilità che Harry ed Hermione avevano dimenticato ai piedi del platano picchiatore prima di addentrarvisi. Il mantello, alla fine, sarà restituito a Harry dal professor Lupin insieme alla mappa del malandrino, poco prima che il professore se ne vada da Hogwarts.

- La prima comparsa di Cho Chang è proprio in questo libro; nel film il suo personaggio viene del tutto omesso, così come quello di Cedric Diggory.

- Nel film l'unico Ippogrifo che vediamo è Fierobecco; nel libro ce ne sono circa una ventina.

- Nel film sono totalmente tagliate le due settimane di Harry a Diagon Alley.

- Nel libro alla partita Grifondoro-Corvonero Malfoy si traveste da Dissennatore ed Harry evoca con successo un Patronus, nel film la partita non viene nemmeno citata.